Amaç: Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikobakteriyoloji Laboratuvarı'na kabul edilen klinik örneklerde Mycobacterium tuberculosis suşlarını belirlemek için iki gerçek zamanlı PCR sistemlerinin tanısal performansının karşılaştırılması amaçlanmıştır.

Gereç ve Yöntem: Mikobakteriyoloji Laboratuvarı'na tüberküloz tanısı amacıyla gönderilen toplam 50 klinik örnek çalışmaya alındı. Kültür pozitif örneklerin 25'i M. tuberculosis kompleks (MTBC) grubu ve 7'si tüberküloz dışı mikobakteri (TDM) olarak tanımlandı. BACTEC MGIT 960 sistem ile duyarlılık testleri çalışıldı. Toplam 50 klinik örneğin moleküler tanısı ise, Mycobacterium tuberculosis'i belirleyen gerçek zamanlı PCR; artus^® M. tuberculosis RG PCR Kit (Qiagen, Hilden, Almanya) (artus^® MTB-PCR) ve GeneXpert MTB/RIF (Cepheid, Sunnyvale, CA, ABD) sistemleri ile yapıldı.

Bulgular: Her iki sistemde de klinik örneğin; %58'inde MTBC pozitif ve %42'sinde negatif olarak bulundu. Kültür yönteminin altın standart kabul edildiği bu çalışmada, artus^® MTB-PCR ve GeneXpert MTB/RIF testlerinin sırasıyla duyarlılığı %72 ve %96, özgüllüğü %56 ve %80, pozitif prediktif değeri (PPD) %62 ve %82 ve negatif prediktif değeri (NPD) %66 ve %95 olarak saptandı. Artus^® MTB-PCR ve GeneXpert MTB/RIF testi bulgularının karşılaştırılmasında da istatistiksel olarak fark yoktu (p>0.05). Kabul edilebilir düzeyde belirlendi (kappa=0.507; p<0.05). Bu çalışmada, 20 solunum sistemi ve 30 solunum sistemi dışı örneklerde; artus® MTB-PCR ve GeneXpert MTB/RIF sistemlerinin uyumu sırasıyla, %75 ve %95 ve %56.6 ve %83.3 olarak bulundu. BACTEC MGIT 960 SIRE testi ile rifampisin duyarlılık testine göre duyarlı olarak belirlenen bir klinik örnek GeneXpert MTB/RIF testi ile belirlenemedi.

Sonuç: GeneXpert MTB/RIF testi MTB'nin klinik örnekte belirlemede, duyarlılı ve özgüllüğü yüksek düzeyde olması ve kısa sürede sonuç verebilmesinden dolayı rutin laboratuvarlarda çalışılabilir. Ancak daha fazla klinik örnek içeren çalışmalara gereksinim vardır.