Amaç: COVID-19 tanısında kullanılan gerçek zamanlı polimeraz zincirleme reaksiyonu (Real-time PCR) testinde test sonuçlarının güvenilir olması kritiktir. Çalışmamızda SARS-CoV-2 genomunu belirlemede Türkiye’de en sık kullanılan üç farklı ticari tanı kitinin farklı Real time-PCR sistemlerindeki uyumunun araştırılması ve bu konuda laboratuvar uzmanlarına bir bakış açısı sunulması amaçlanmıştır.

Yöntem: Bu çalışmada, 46 COVID-19 hastasının kombine oro/nazofarengeal sürüntü örneği kullanılmıştır. Bu örnekler SARS-CoV-2 genomunu saptamak üzere Diagnovital, Bio-Speedy ve Coronex tanı kitleri kullanılarak Rotor-Gene, Bio-Rad ve Abbott Real-time PCR cihazlarında çalışılmıştır. Çalışmalarda elde edilen Ct değerleri kaydedilmiştir. Kullanılan kitlerin cihazlar arasında yalnızca Abbott ile validasyonu bulunmamaktadır.

Bulgular: Çalışmamızda SARS-CoV-2 saptanmasında en düşük ve en yüksek Ct değerleri sırasıyla Rotor-Gene – Bio-Speedy ve Abbott - Diagnovital cihaz-kit ikililerinde gözlenmiştir. Düşük viral yüklü örneklerin saptanmasında da sonuç aynı bulunmuştur. Çalışmaların hepsi değerlendirildiğinde, Diagnovital kitinin kitler arasında en yüksek Ct değerlerini verdiği görülmüştür.

Sonuç: SARS-CoV-2 saptanmasında Rotor-Gene – Bio-Speedy ikilisi ile bu ikiliye çok yakın saptanan Bio-Rad - Bio-Speedy ikilisi diğer cihaz-kit ikililerinden daha uyumlu bulunmuştur. Yanlış negatifliklerin ve yüksek Ct değerlerinin elde edilmesi erken taburculuklara veya karantinanın uygulanmamasına, böylece bulaşıcılığın artmasına neden olabilir. Bu nedenle, Diagnovital kitinin çalışmamızdaki Real-time PCR cihazlarında saptanan değişken performansının da gösterdiği gibi, bir PCR kitinin rutin tanı amaçlı kullanımı planlandığında, laboratuvarda kullanılacağı cihazla uyumluluğunun değerlendirilmesi oldukça önemlidir.