2016, Cilt 46, Sayı 1, Sayfa(lar) 008-017 |
[ Özet ]
[ PDF ]
[ Benzer Makaleler ]
[ Yazara E-Posta ]
[ Editöre
E-Posta ]
|
Demir Stresine Direnç Kazandırılmış Saccharomyces cerevisiae Mayasının Demir Taşınımı ile İlişkili Genlerinin Anlatım Düzeylerinin Gerçek Zamanlı, Kantitatif Polimeraz Zincir Reaksiyonu (q rt-PCR) ile Belirlenmesi |
Berrak Gülçin BALABAN1,2, Ülkü YILMAZ1,2, Ceren ALKIM1,2, Zeynep Petek ÇAKAR1,2 |
1İstanbul Teknik Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü, İstanbul 2İstanbul Teknik Üniversitesi, Dr. Orhan Öcalgiray Moleküler Biyoloji-Biyoteknoloji ve Genetik Araştırmalar Merkezi, İstanbul |
Anahtar Kelimeler: Demir direnci, q rt-PCR, Saccharomyces cerevisiae |
Özet |
Amaç: Çalışmanın amacı, model organizma olarak demire
dirençli Saccharomyces cerevisiae mayası kullanılarak, demir
iyonlarının taşınımından sorumlu genlerin demir direnç mekanizmasındaki
rolünün deneysel olarak araştırılmasıdır.
Gereç ve Yöntem: Önceki çalışmalarımızda, demir direnci
kazandırılmış olan S. cerevisiae M8FE suşu, bu çalışmada
S. cerevisiae CEN.PK113-7D referans suşu ile birlikte kullanılmıştır.
Referans suş ile karşılaştırmalı olarak, M8FE'nin demir
taşınımıyla ilişkili olduğu bilinen AFT1, FET3, FET4, COT1,
CCC1 ve ZRC1 genlerinin anlatım düzeyleri; kontrol, düşük (1
mM) ve yüksek (15 mM) demir stresi altında, gerçek zamanlı,
kantitatif polimeraz zincir reaksiyonu (q rt-PCR) yöntemiyle
belirlenmiştir.
Bulgular: İncelenen genler arasında, anlatım düzeyleri en çok
farklılaşan gen FET3'tür. Demire dirençli M8FE suşunda, 1mM
demir stresi varlığında bu genin anlatım düzeyi, kontrol koşulundaki
referans suşununkinin yaklaşık 16 katına, yüksek demir
stresi (15 mM) varlığındaysa yaklaşık üç katına çıkmıştır.
CCC1 ve COT1 genlerinin anlatımında da genel olarak anlamlı
bir artış gözlenmiştir. AFT1 geninin anlatım düzeyleri, yüksek
demir stresi varlığında azalırken, FET4 genininki ise düşük
demir stresi varlığında artmıştır. ZRC1 geni ise, yalnızca yüksek
(15 mM) demir stresi altındaki M8FE'de, kontrol koşullarındaki
referans suşunun anlatım düzeyinin yaklaşık üç katına
çıkmıştır. Yüksek demir stresi, M8FE'de ZRC1 gibi CCC1 ve
COT1 genlerinin anlatımında da ciddi bir artışa neden olmuştur.
Sonuç: Gen anlatım düzeylerinin analizine dair bulgular, FET3
ve AFT1 genlerinin demir direnci ve ortamdaki demir iyonları
düzeyiyle ilişkili olduğunu göstermektedir. Gen anlatım düzeyi
verileri, vakuole demir taşınımından sorumlu CCC1 geninin ve
çinko ile kobaltın vakuole taşınımından sorumlu ZRC1 ve
COT1 genlerinin de yüksek demir stresi varlığında vakuole
demir taşınımı ve demir direnci ile ilişkili olabileceğine işaret
etmektedir. |
Başa Dön
Özet
|
[ Başa Dön ]
[ Özet ]
[ PDF ]
[ Benzer Makaleler ]
[ Yazara E-Posta ]
[ Editöre
E-Posta ]
|