2021, Cilt 51, Sayı 2, Sayfa(lar) 156-162 |
[ İngilizce Özet ]
[ PDF ]
[ Benzer Makaleler ]
|
Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus (MRSA)’dan Elde Edilen Fajın Karakterizasyonu |
Özlem Ulusan Bağcı, Fikret Şahin, Mehmet Kıyan |
Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye |
Anahtar Sözcükler: Bakteriyofaj, faj tedavisi, Staphylococcus |
Amaç: Mevcut olan bütün antimikrobiyallere dirençli Staphylococcus aureus suşlarının ortaya
çıkması ve yeni antibiyotik bulunamaması araştırmacıları antibiyotiklerin keşfi ile popülerliğini
kaybetmiş olan faj tedavisine yönlendirmiştir. Rekombinant teknolojinin gelişimi bakteri ölümünü
kontrollü olarak sağlayan lizojenik rekombinant fajların oluşturulması düşüncesini ortaya çıkarmıştır.
Bunun için manipülasyonu kolay küçük boyutlu fajlara gereksinim duyulmaktadır. Bu
çalışmadaki amacımız, tedavide güvenle kullanılabilecek küçük boyutta lizojenik bir bakteriyofajın
tanımlanmasıdır.
Yöntem: Bu çalışmada, küçük bir faj içerdiği bilinen MRSA suşundan faj ekstrakte edilerek sekans
analizi sonucunda gen ve protein haritası çıkarılmıştır.
Bulgular: Faj; kuyruk proteinlerini kodlayan genler içermesi nedeniyle Caudoviralese; genom
büyüklüğü ve dizilimi göz önünde bulundurularak Podoviridae sınıfına dâhil edilmiştir.
Sonuç: Bugüne kadar NCBI veritabanına yüklenmiş yalnızca 16 adet Podoviridae ailesinden faj
bulunmakta olup, bu çalışmada tanımlanan faj ise on yedincidir. Genomdaki AOÇ’lerin (Açık
Okuma Çerçevesi) yalnızca %41.4’ü NCBI BLAST programı kullanılarak proteinlerle eşleştirilebilmiştir.
Yapılan son araştırmalarda, çalışmamızla uyumlu olarak bakteriyofaj genomundan olduğu
tahmin edilen AOÇ’lerin %50-75’inin GenBank’ta karşılığı olmadığı belirtilmiştir. Bakteriyofajları
daha iyi anlayabilmek ve faj terapisinde fajlardan daha iyi yararlanabilmek için daha fazla fajın
dizilenmesi, genomlarının ve karşılık geldiği proteinlerin bulunması gerekmektedir. Bu nedenle
çalışmamızın, rekombinant faj terapilerinde güvenle kullanılabilecek lizojenik bir fajın gen ve
proteinlerinin tanımlanmış olması nedeniyle literatüre katkı sağlayacağını düşünmekteyiz.
|
[ İngilizce Özet ]
[ PDF ]
[ Benzer Makaleler ]
|